Le Réseau FEF est administré par un Comité National, qui se veut le plus représentatif possible de ses unions membres. Il définit la vision et la stratégie du Réseau FEF et les soumet à l’approbation des membres lors des assemblées générales. Les membres du Conseil National se retrouvent 4 fois par an pour prier et définir les grandes priorités du Réseau FEF.